Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPLO60437 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PPLO60437 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PPLO60437 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPLO60437 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPLO60437 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPLO60437 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPLO60437 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPLO60437 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPLO60437 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPLO60437 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPLO60437 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PPLO60437 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPLO60437 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PPLO60437 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPLO60437 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPLO60437 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPLO60437 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPLO60437 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPLO60437 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPLO60437 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PPLO60437 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PPLO60437 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PPLO60437 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPLO60437 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPLO60437 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPLO60437 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPLO60437 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPLO60437 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPLO60437 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPLO60437 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPLO60437 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PPLO60437 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PPLO60437 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPLO60437 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPLO60437 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPLO60437 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPLO60437 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PPLO60437 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPLO60437 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PPLO60437 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPLO60437 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPLO60437 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPLO60437 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPLO60437 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPLO60437 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPLO60437 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPLO60437 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPLO60437 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PPLO60437 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPLO60437 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPLO60437 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPLO60437 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPLO60437 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPLO60437 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PPLO60437 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms