Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP9O43818 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP9O43818 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP9O43818 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP9O43818 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP9O43818 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP9O43818 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP9O43818 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP9O43818 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP9O43818 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRP9O43818 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RRP9O43818 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RRP9O43818 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RRP9O43818 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRP9O43818 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRP9O43818 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP9O43818 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP9O43818 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP9O43818 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP9O43818 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP9O43818 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP9O43818 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP9O43818 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP9O43818 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP9O43818 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRP9O43818 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP9O43818 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms