Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYNGR2O43760 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms