Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX6O43752 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX6O43752 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX6O43752 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STX6O43752 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STX6O43752 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STX6O43752 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX6O43752 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX6O43752 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX6O43752 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX6O43752 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX6O43752 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX6O43752 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX6O43752 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms