Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACTN4O43707 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTN4O43707 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms