Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DENRO43583 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DENRO43583 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DENRO43583 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DENRO43583 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DENRO43583 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DENRO43583 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DENRO43583 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DENRO43583 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms