Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNAB3O43448 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNAB3O43448 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms