Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF3O43395 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms