Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms