Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCP110O43303 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCP110O43303 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCP110O43303 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCP110O43303 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCP110O43303 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCP110O43303 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCP110O43303 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCP110O43303 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCP110O43303 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCP110O43303 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCP110O43303 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCP110O43303 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCP110O43303 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCP110O43303 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCP110O43303 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCP110O43303 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCP110O43303 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCP110O43303 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCP110O43303 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCP110O43303 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCP110O43303 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCP110O43303 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCP110O43303 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCP110O43303 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCP110O43303 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCP110O43303 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCP110O43303 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCP110O43303 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms