Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPAA1O43292 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAA1O43292 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms