Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TXNDC9O14530 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TXNDC9O14530 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms