Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PIK3C2AO00443 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3C2AO00443 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms