Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2K7ER74 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms