Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms