Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMO7DNF2Z398 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO7DNF2Z398 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms