Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCRIP1C9JLW8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCRIP1C9JLW8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms