Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERVV-1B6SEH8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-1B6SEH8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms