Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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