Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5BA8MYB1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms