Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMTNL1A8MU46 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMTNL1A8MU46 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms