Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CFAP73A6NFT4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms