Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HELTA6NFD8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HELTA6NFD8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms