Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00862A6NCI5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms