Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTAGE9A4FU28 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTAGE9A4FU28 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms