Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TARSL2A2RTX5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TARSL2A2RTX5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms