Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRGMA1A4Y4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRGMA1A4Y4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms