Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POTEB3A0JP26 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms