Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms