Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
A0A0D9SFI3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0D9SFI3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms