Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDY1Q9Y6F8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms