Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CHTOPQ9Y3Y2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHTOPQ9Y3Y2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHTOPQ9Y3Y2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHTOPQ9Y3Y2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CHTOPQ9Y3Y2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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CHTOPQ9Y3Y2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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