Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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HCN4Q9Y3Q4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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HCN4Q9Y3Q4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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HCN4Q9Y3Q4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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HCN4Q9Y3Q4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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HCN4Q9Y3Q4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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HCN4Q9Y3Q4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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HCN4Q9Y3Q4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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HCN4Q9Y3Q4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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