Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms