Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms