Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL20Q9Y2M5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms