Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHKBQ9Y259 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms