Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFSF18Q9UNG2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF18Q9UNG2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms