Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNPO2Q9UMS6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms