Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA11Q9UKX5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA11Q9UKX5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms