Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATPIF1Q9UII2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms