Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLCO3A1Q9UIG8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms