Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP25Q9UHP3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms