Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPC1L1Q9UHC9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms