Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms