Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC59Q9P031 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC59Q9P031 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms