Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CWC15Q9P013 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms