Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms