Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL2Q9NY43 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms