Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PGPEP1Q9NXJ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGPEP1Q9NXJ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PGPEP1Q9NXJ5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms